シャチが見れるのはいいのだが、どうも動線が悪く立派な水族館ではあるが「古い施設」と言う感じがする。また自慢のシャチやイルカのパフォーマンスも「動物愛護」の観点から今は「動物に芸をさせる」というのがダメらしく、あくまで訓練を見せるとか、遊ぶのを見せると言うショー構成になっているが（これはオープン当初からですが）、相変わらず間延びすると言うか何がしたいのかよくわからないショー構成だった。ものすごく立派で素晴らしい水族館であるのは間違い無いのですが、ここのショーのありかたと言うのは昔からものすごく不満に感じる部分です。「芸をさせてますが、大人の都合で遊んでる（訓練してる）のをみせてるだけです」と無理矢理こじつけているのが見えすぎる。もっと動物と観客が一体化するような遊びの演出をすればいいなと思う。
あと北館と南館の連絡通路は閉館時間の30分前に通行が制限され行き来出来なくなってしまいます。何故こんな事をしているのかよくわからないのですが、駅に近い北館から入場し「ベビーカー」を借りた場合･･･閉館時間の30分前に南館に居た場合、ベビーカーを返却する為にわざわざ館外に出て北館のエントランスまでベビーカーを持って行かなければなりません。返却の為には連絡通路の通行をOKにするとか対応を求めたいところです。